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生态环境主管部门负责卫河水生态环境监督管理工作。

水行政主管部门负责卫河水资源利用、防洪减灾监督管理工作。

发展改革、工业和信息化、公安、财政、自然资源和规划、林业、住房和城乡建设、城市管理、交通运输、农业农村、应急管理等部门按照各自职责，做好卫河保护和管理工作。