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市场监督管理部门是农贸市场的主管部门，负责农贸市场的综合监督管理。

商务部门负责编制农贸市场网点专项规划，指导农贸市场升级改造工作。

农业农村部门负责对经营动物、动物产品的农贸市场的防疫条件等情况进行监督检查。制定并组织实施农产品质量安全监测计划，对市场上销售的农产品进行监督抽查。

公安、自然资源、住房城乡建设、卫生健康、城市管理、消防救援等其他有关部门按照各自职责做好农贸市场监督管理工作。