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牡丹产业发展服务工作机构负责牡丹产业链条融合发展督导，以牡丹为载体的宣传、交流合作等工作。

林业主管部门负责牡丹产业综合协调、统筹推进、政策指导，牡丹种质资源保护，牡丹科技知识普及与人才培训，牡丹标准化生产推广等工作。

工业和信息化部门负责推动牡丹加工企业技术改造，提升生产加工能级，培育牡丹加工企业等工作。

市场监督管理部门负责牡丹产品质量监管、品牌建设、标准化建设、知识产权保护等工作。

商务部门负责牡丹市场流通、电商培育、对外贸易等工作。

文化和旅游部门负责指导发掘和弘扬牡丹文化，促进文化旅游业与牡丹产业融合发展等工作。

发展改革、财政、教育和体育、科学技术、人力资源社会保障、自然资源和规划、城市管理、水务、农业农村等与牡丹产业发展有关的部门和单位按照各自职责，做好牡丹产业发展相关工作。