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市人民政府生态环境主管部门对晋江、洛阳江流域水环境保护实施统一监督管理。

市、县（市、区）人民政府发展和改革、工业和信息化、公安、自然资源、城乡规划、住房和城乡建设、交通运输、农业农村、林业、水利、商务、卫生健康、应急管理、海洋与渔业、城市管理等主管部门在各自的职责范围内，对流域水环境保护实施监督管理。